Anos 80
Em 1980, foi aprovado o III PBDCT, com vigência até 1985, mais flexível e mais político que os anteriores, apresentou uma novidade: seu desdobramento em 26 outros documentos denominados de Ação Programada, nos quais são propostas linhas e diretrizes para os setores sócio-econômicos ali enunciados. Nesse período, o CNPq tentou ampliar sua atuação operando em diversas frentes:
- descentralização do gerenciamento das atividades de C&T com a implementação dos Sistemas Estaduais de Ciência e Tecnologia - SECT's;
- igual tratamento às ciências humanas e às sociais aplicadas, com a introdução de novas áreas de conhecimento nas atividades de fomento;
- criação do Programa de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - PADCT, com investimentos em torno de US$375 milhões;
- criação de amplo programa editorial, com a reformulação da Revista Brasileira de Tecnologia, a publicação de dezenas de documentos institucionais, a sistematização e fortalecimento do apoio a revistas científicas e a edição de livros em parceria com editoras particulares;
- maior alocação de recursos de agências internacionais, por meio de convêncios com o Banco Interamericano de Desenvolvimento - BID, e o Banco Mundial - BIRD;
- criação do Prêmio Jovem Cientista no dia 12/08/1982;
- implementação da Rede Nacional de Pesquisa - RNP, que levou à implantação da internet brasileira.
Em 1985, com a criação do Ministério de Ciência e Tecnologia, o CNPq passou a ser vinculado ao órgão que se tornou o centro do planejamento estratégico da ciência no Brasil. Criado pelo Decreto nº 91.146 - 15 de Março de 1985, o Ministério da Ciência e Tecnologia é postulado como órgão central do sistema federal de Ciência e Tecnologia. Assume, portanto, várias áreas de competência: o patrimônio científico e tecnológico e seu desenvolvimento; a política de cooperação e intercâmbio concernente a esse patrimônio; a definição da Política Nacional de Ciência e Tecnologia; a coordenação de políticas setoriais; a política nacional de pesquisa, desenvolvimento, produção e aplicação de novos materiais e serviços de alta tecnologia. O CNPq é subordinado a Presidência da República até 15.03.1985 quando, então, passa a integrar o Ministério de Ciência e Tecnologia como entidade vinculada.